Univerzita Karlova

Title, type and description of public contract

• Title: UK2LF – Sekvenační platforma nové generace pro analýzy lidského genomu (hardware)
• Type of public contract: Supplies

Brief subject description:
Předmětem plnění veřejné zakázky je dodávka a instalace nového, dosud neužívaného, nerepasovaného, plně funkčního 1 ks přístroje pro sekvenční analýzu DNA, 1 ks přístroje pro střih DNA a 3 ks různých serverů (výpočetních stanic).
Předmět plnění spočívá v následujícím plnění:
1 kus přístroje pro „masivně“ paralelní sekvenační analýzu založenou na principu tzv. long-read DNA sequencing, tedy technologie sekvenování DNA pomocí dlouhých čtení. Toto zařízení bude zkoumat regiony, nové geny, genetickou variabilitu, nové strukturní varianty, polynukleotidové expanze a regulační prvky, které spadají do tzv. "dark regions", tedy nedostupné stávajícím technologiím tzv. krátkých čtení DNA. Musí být použitelný pro výzkum, diagnostiku a léčbu vzácných onemocnění v rámci Evropských referenčních sítí pro vzácná onemocnění ultravzácných onemocnění a mezinárodní výzkumné sítě HiFi Global Consortium.
1 kus přístroje pro kontrolovanou fragmentaci – střih DNA. Přístroj umožňuje plně automatický střih DNA na velikost vzorků minimálně v rozmezí 5 až 100 kb, rychlostí minimálně 90 vzorků za 120 minut.
3 kusy související výpočetní techniky tzn. serverů pro zpracování surových dat ze zařízení, server pro ukládání a zálohování výsledků sekvenování a analýzy dat výpočetní a pracovní stanici pro bioinformatickou analýzu, optimalizované pro spolupráci s výše uvedenými přístroji to vše dle této zadávací dokumentace a zejm. dle technické specifikace veřejné zakázky.

Procedure type, estimated value

• Procedure type: open procedure
• Public contract regime: above-the-threshold
• Estimated value: 8 504 132 Kč without VAT
• Subsidy project identifier: Operační program Jan Ámos Komenský, registrační číslo projektu: CZ.02.01.01/00/23_015/0008183

Place of performance

• Praha

Contracting authority

• Official name: Univerzita Karlova, 2. lékařská fakulta
• CRN: 00216208
• Postal address:
  V Úvalu 84/1
  150 06 Praha
• Contracting authority profile identification in VVZ: Z2017-028439

Contact address

Tenders or requests to participate submit to:
prostřednictvím elektronického nástroje E-ZAK (https://zakazky.cuni.cz)